有机肥料是指含有大量有机物的肥料。池塘施用的有机肥料主要包括绿肥、粪肥、混合堆肥、厩肥、生活污水及无毒的食品加工厂（场）废水等。有机肥料的优点是肥效全面，作用持久，缺点是肥效较迟，且耗氧多，也易污染水质。有机肥料是我国池塘施肥至今为止使用的主要肥料。

（一）绿肥

绿肥包括多种野生的无毒草本植物和人工栽培的植物。只要是无毒的、茎叶易于浸腐分解的植物均可，其中以无毒的菊科、豆科植物为好。部分禾本科植物，甚至某些树叶都可作为绿肥施用于池塘。农作物如瓜的蔓叶、蔬菜均可作为绿肥。

广东、广西地区把池塘施用的绿肥称之为“大草”。“大草”原是指一些野生无毒的、茎叶柔嫩、含木质素少的、易于浸腐且肥分高的豆科和菊科植物，而今也泛指绿肥。

（二）粪肥

粪肥包括人粪尿、禽畜粪尿等。厩肥主要是家畜粪尿、草、草木灰及少量残余饲料。

1.人粪尿

人粪尿是肥效较快、肥分全面的有机肥料。肥分依人进食的食物而异。其含氮量特别丰富，除氮、磷、钾外，还有一定量的钙、硫等元素。池塘施用人粪尿对繁殖浮游植物有利。

2.家畜粪尿

家畜粪尿主要是猪、牛、马、羊、骡、驴等家畜的粪尿。其肥分随畜进食的饲料不同有很大的差别。例如奶牛的饲料中由于豆类等精饲料较多，故奶牛粪便肥分通常要比其他家畜粪高得多。

一般来说，家畜粪便肥分中含有大量的纤维素，也含有少量的蛋白质、脂肪、糖类、叶绿素，其氮的含量通常比人粪尿低。家畜粪尿较人粪尿难于腐熟分解，故肥效较人粪尿迟，肥分也较人粪尿低。家畜粪尿对繁殖浮游动物有利。

3.家禽粪尿

家禽粪尿的肥分随摄食饲料的种类及营养成分而异，其肥分通常较家畜粪肥高，其尿素盐含量也高。