1.食物链

利用食物链，通过在水体中放养滤食性的鱼类可以初步达到控制蓝藻的目的。合理搭配滤食性鱼类(比如白鲢)是最有效的防控措施，很多人认为花鲢好吃又值钱，重鳙轻鲢，有些人认为花鲢(鳙鱼)也是滤食性鱼类，就只混养花鲢而不套养白鲢或者套养很少的白鲢。其实，花白鲢虽然都是滤食性调节水质的鱼类，但花鲢偏重于动物性饵料食性，而蓝藻是植物性水生物质，恰好白鲢的食性则以植物性饵料为主食性，此处不言自明了。因此，放养一定数量的滤食性鱼类(如白鲢)是根治蓝藻暴发的首选措施。

据说，尾重200克以上的白鲢对蓝藻有明显的抑制作用，每亩总量达到200斤时，基本不会爆发蓝藻。也有人在实验中发现，以400尾/亩花白鲢密度的放养，就能够对蓝藻达到很好的控制效果。在2000—2003年期间，中科院水生生物研究所在滇池进行了养殖白鲢和花鲢鱼治理蓝藻的实验，结果是1条2斤左右的花鲢鱼1个月能吃掉4斤蓝藻，同样大小的1 条白鲢鱼，1个月能消耗7斤多的蓝藻。

2.适度降低池水pH值

3.调整氮多磷少比例

如果是化肥养鱼，则应特别注意氮磷比例，适合蓝藻生长所需的氮磷比为7.2：1，氮多磷少。因此，一般条件下，尿素和过磷酸钙的搭配比例应为：100斤尿素搭配200斤过磷酸钙为宜。特别是池塘和底层有机质比较多，加大磷肥用量尤为必要。适量加施磷肥，培养有益藻类，也可预防蓝藻的发生。