1.水温突变

夏季天气经常会产生突变，晴天光照强烈，气温高，水温也高；在阴雨天气下，无光照，再加上雨水是高空冷暖空气对流产生的结果，一般而言，雨水的温度要远远低于养殖水体的温度；如果长时间的降雨，将会使水体温度持续降低，特别是当降雨发生在中午时，水温的变化就更大了，很容易引起鱼、虾、蟹的应激反应。若无外来动力的作用，表层水温往往较低，会出现池塘水体分层的现象。当水温骤降导致鱼、虾、蟹不能适应时，就会引起鱼、虾、蟹消化系统和免疫系统功能降低，常出现不摄食，消化吸收不良，出现空胃、空肠以及肝脏不正常等现象；而免疫功能降低后，鱼、虾、蟹的抗病力较差，在病菌浓度较低的情况下也容易感染各种疾病。

2.酸碱度变化

由于吸收了空气中的二氧化碳等物质，所以雨水通常是显酸性的。正常池塘养殖水体的pH值在8.0-9.0，而连续阴雨天气使得弱酸性的雨水不断注入池塘，导致池塘水体pH值持续降低；若突遇暴雨，大量雨水汇入池塘，水位急剧升高，pH值也会大幅度降低，极易引起池塘养殖品种产生应激反应。

3.溶解氧降低

鱼、虾、蟹要良好生长，养殖水体中一般要求溶解氧在4mg/L以上。池塘中的溶解氧除了来自空气以外，主要依靠浮游植物等水生植物的光合作用产氧。但连续多天的阴雨天气，光照强度较弱，池塘水体中浮游植物的光合作用迅速下降，而呼吸作用仍在继续，造成水中所含溶解氧降低，再加上水体表面温度下降，水体内对流作用较强，池底氧债急速增大，特别容易发生鱼、虾、蟹浮头和泛塘。另外，雨季时阳光减弱，还会使许多浮游藻类死亡，消耗水中氧气，进一步引起水中溶解氧减少。而藻类死亡后，为细菌繁殖提供了有利条件，极易使鱼虾发病。

4.藻类的变动

雨季，尤其是长时间阴雨天或暴雨，长时间光照强度不足，藻相可能在几个小时内迅速更替，且一般由原来的优良藻相变为劣质藻相。即原来占据优势种群的藻类在环境条件突变的情况下突然大量死亡，而原来的劣势藻类迅速繁殖。常见的是春夏之交时，优势藻类是由硅藻、绿藻为主的，如果遇到连续阴雨和暴雨后，极易转换为蓝藻、裸藻为主。另外，连续的阴雨天气可能会使藻类全部死亡，浮游动物、原始动物等大量增殖，透明度大幅度增加，甚至清澈见底，基本没有水色或发白。这种情况除了会引发池塘鱼虾缺氧外，水体中死亡的藻类分解时，会产生大量的藻毒素，影响鱼虾摄食甚至导致中毒死亡。同时，因藻类死亡，也使藻类分泌的抑制细菌生长的类抗生素物质急剧下降，各类病原菌迅速繁殖，容易引发鱼、虾、蟹细菌病。

5.底质变差

连续阴雨天气期间，池底淤泥因长时期的缺氧，有机物无法进行正常的氧化分解，持续无氧发酵，产生了大量的对鱼、虾、蟹有害、有毒的物质，如甲烷、硫化氢、氨氮、亚硝酸盐等，并随着厌氧细菌的繁殖和水质的恶化，大量条件性致病细菌增多，引起鱼、虾、蟹摄食下降，残饵增加，发病率大大增加。